Monocle2: plot_genes_branched_he
2024-01-11 本文已影响0人
LET149
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绘制含有分支的基因沿拟时间表达的热图
此函数在绘制后会返回绘制热图所用的数据,包括各个
branch独立的数据,以及行列的聚类数据
1. 各个branch的数据提取
kk <- plot_genes_branched_heatmap()
kk$BranchA_exprs
2. 提取行聚类信息
kk <- plot_genes_branched_heatmap(num_clusters=3, return_heatmap=T)
pp <- cutree(kk$ph$tree_row, k=3)