scRNA---Day8(scater)

续昨

可视化：

按示例数据选取前6个基因，一般实验中选取marker基因：

6geneplot.png 6plot.png

降维

1. runPCA()

2. t-distributed stochastic neighbour embedding (t-SNE)

   
   multiplot.png

PCAplot.png plateplot.png Trf-gplot.png Trfplot.png Trf-sizeplot.png tsneplot.png tsne-Trfplot.png

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数据图不好看，主要是为了理解流程走代码