rMATS 4.1.2 安装

2022-01-11 本文已影响0人青青鸟_341e

最近打算做可变剪切分析，查了做分析的软件发现rMATS这个软件被很多人推荐，于是打算就用它来分析吧。
本着方便易懂的原则，搜索了“rMATS安装教程”。发现都讲的不是很明白而且最新版也到了4.1.2，我还是想安装最新版。查了很多资料，有说用conda的，也有说有docker的，我试了一圈，都没能安装成功。该走的弯路都走了，具体过程就不分享了，免得误导大家，接下来我把我安装的方法写下来，希望能有点用。

1. 打开官网

http://rnaseq-mats.sourceforge.net/rmats4.1.2/

官网

2. 下载软件安装包

下载软件安装包

3. 上传到服务器并解压

上传到服务器并解压

解压安装包

4. 找到官网安装说明

https://github.com/Xinglab/rmats-turbo

安装说明

安装所需要的的环境
每个人的机器环境不一样，这个所需要的的环境需要自己配置，我就是没有管这个环境直接解压后安装的，遇到error或failed再去看报错一一解决。

5. 安装

进入到解压后的安装包

进入解压后的目录

./build_rmats

根据报错信息再去处理软件安装所需要的环境。

6. 我安装遇到的报错信息

我安装遇到的报错信息，希望对大家有所帮助。

6.1 gsl-config报错

一看到报错信息就头疼，由于看过https://jingyan.baidu.com/article/63acb44a13cc7d61fdc17e6d.html里面的一些内容所以就怀疑是不是缺少包“gsl-config”，于是就到百度搜索了这个包，果然发现了解决方法。https://blog.csdn.net/subiluo/article/details/86479836