100篇泛癌研究文献解读目录列表

为了分析不同类型、组织起源肿瘤的共性、差异以及新课题。TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹，加州举行的会议中发起了泛癌计划。参考：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6000284/ 为此我也录制了系列视频教程在：TCGA知识图谱视频教程（B站和YouTube直达）

第一批官方泛癌研究（CNS）

• 100篇泛癌研究文献解读之癌症相关基因的饱和度分析

• 100篇泛癌研究文献解读之肿瘤病人新的分类方法

• 100篇泛癌研究文献解读之突变全景图

• 100篇泛癌研究文献解读之根据点突变和拷贝数变异共同分组

突变

• 100篇泛癌研究文献解读之PhyloWGS算法的肿瘤内部异质性和基因组不稳定性

• 100篇泛癌研究文献解读之使用EXPANDS和PyClone量化肿瘤内部异质性

• 100篇泛癌研究文献解读之癌症驱动基因

免疫

• 100篇泛癌研究文献解读之肿瘤免疫浸润情况

• 100篇泛癌研究文献解读之ESTIMATE算法计算肿瘤纯度

针对某生物学功能基因集

• 100篇泛癌研究文献解读之上皮细胞-间充质细胞转化

• 100篇泛癌研究文献解读之同源重组修复通路

• 100篇泛癌研究文献解读之微卫星不稳定性

• 100篇泛癌研究文献解读之合成致死事件

• 100篇泛癌研究文献解读之核受体基因家族探索

• 100篇泛癌研究文献解读之激酶相关基因融合事件

• 100篇泛癌研究文献解读之磷酸化相关点突变

• 100篇泛癌研究文献解读之APOBECs家族基因突变及表达量异常

表观

其它

• 100篇泛癌研究文献解读之原位癌症和转移癌症的区别

• 100篇泛癌研究文献解读之驱动lncRNA

• 100篇泛癌研究文献解读之lincRNA的生存分析情况

• 100篇泛癌研究文献解读之生存分析相关基因

• 100篇泛癌研究文献解读之非编码区调控原件的突变情况

• 100篇泛癌研究文献解读之可变剪切事件大起底

• 100篇泛癌研究文献解读之病毒感染及整合到肿瘤病人基因里

第二批官方泛癌研究（CNS）

• 100篇泛癌研究文献解读之snoRNAs