文章套路转录组

miRNA的下一个研究浪潮?A-to-I edited miRN

2021-02-08  本文已影响0人  唯问生物

     提到非编码RNA,大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究,miRNA-lncRNA研究等等。小编最近发现了一个miRNA的新研究:A-to-I edited miRNA。虽然它不是刚出现,但我想还是有很多人跟我一样初次遇见它

    A-to-I是adenosine-to-inosine (腺苷-肌苷)的缩写。A-to-I 是广泛存在于人类中的一种RNA编辑方式,其机制是腺苷脱氨酶(ADARs)结合RNA分子的双链区域将腺苷脱氨成肌苷。肌苷在细胞内会被识别为鸟苷,导致转录本中的非同义密码子变化以及产生选择性剪接。这种方式发生于转录后水平,不影响DNA序列。RNA-Seq的出现(与基因组比对)使得大量RNA编辑位点被识别,包括A-to-I编辑位点。目前,广泛使用的A-to-I编辑位点数据库是RNA编辑数据库(DARNED,http://darned.ucc.ie)。

    言归正传,我们回到A-to-I edited miRNA。发生在miRNA序列上的A-to-I editing 会影响miRNA的靶向性并破坏其成熟,从而影响其功能发挥,包括其在癌组织细胞中的表达和功能。下面以miR-379-5p为例,介绍A-to-I edited miRNA在癌症中的功能改变。在癌症中存在着wild-type miR-379-5p和A-to-I edited miR-379-5p。

A-to-I edited miR-379-5p在结肠癌,头颈癌,肺癌等7种癌组织中的表达水平均低于正常组织。

而生存分析表明高水平A-to-I edited miR-379-5p能够延长肺癌和肾癌患者的无病生存期。

A-to-I editing同样引起了miR-379-5p靶基因的改变,wild-type miR-379-5p的靶基因是PTK2, 而A-to-I edited miR-379-5p则靶作用于CD97。

功能分析表明A-to-I edited miR-379-5p可通过靶作用于CD97介导癌细胞凋亡,从而发挥抑癌作用。

看完我的介绍,大家是不是都对A-to-I edited miRNA产生了浓厚的兴趣呢?

参考文献:

Xu X, Wang Y, Mojumdar K, et al. A-to-I-edited miRNA-379-5p inhibits cancer cell proliferation through CD97-induced apoptosis. J Clin Invest (IF = 12.282). 2019;129(12):5343‐5356. doi:10.1172/JCI123396

上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读