细胞交互的验证

细胞交互，横纵兼容

在受体细胞的部分跟前面的教学一脉相承，方法可以继承过来，横向的多元变量组合，纵向 的分子修饰、剪切都可以兼容

分泌吸收，跨越回复

除了受体细胞的横纵兼容外，供体细胞的分泌 和受体细胞的吸收过程都是需要验证并提供数据的。

在回复实验中，操作主变量往往不在受 体细胞，可以在供体细胞，也可以阻断运输载体，同时在受体细胞逆转下游效应环节观察表 型，这就有跨越细胞进行两个变量操作的属性。只有跨越细胞能够实现的表型回复，才能说 明细胞交互本身对于信号传导的必要性，这一点跟单细胞模型的思路存在区别。

主变量是lncRNA

但是 lncRNA 比 miRNA 更加复杂的地方在于，一旦研究深入到直接机制的范畴，miRNA 只 需要考虑靶基因 RNA-RNA 交互作用一种模式就行了

lncRNA 的作用形式从 RNA-RNA 到 RNA-蛋白，还有 RNA-DNA 都是能走通的，甚至还有三元直接交互————RNA 连接两个蛋白，或者 RNA 连接蛋白和 DNA 的交互作用（RNA 交互和蛋白交互两个方向）

1）RNA方向
lncRNA 介导 ceRNA 机制的套路玩法。 ceRNA 是一套至少三元变量、两组 miRNA 直接机制的组合套路，工作量比 miRNA+靶基因的二元 策略增加了一倍不止 只要把必要的论证环 节都充分照顾到。

ceRNA 再升级一下，就可以与细胞交互结合起来，在受体细胞里面做一 套 ceRNA 论证，再加上外泌体中 lncRNA 主变量的差异表达、细胞交互的功能表型、外泌 体的特征鉴定数据、阻断供体细胞 lncRNA 的 lossoffunction 以及供体细胞 lncRNA 表达改 变的上游机制等等。
1）蛋白方向
在胞核其作用可以考虑顺式作用，调节下游基因转 录；
在胞浆定位可以从转录后、翻译水平的调控入手。

3）场景
表达差异的筛选和验证是在囊泡中的，需要阻断囊泡或者沉默供体细胞 的目标 lncRNA 分子，来观察供体细胞分泌产物对受体细胞的表型影响，用细胞上清刺激或 者 Transwell 共培养体系来进行细胞交互操作。分泌讨论完还有吸收问题，要先用电镜、 Biomarker 等验证囊泡特性，然后用荧光示踪观察受体细胞摄入情况，甚至还要标记 lncRNA 证明供体细胞发挥功能的分子是来源于受体细胞的。这些数据都补充完，才跟 lncRNA 与蛋 白互作介导靶基因 m6A 甲基化这个直接机制内容连接上

基础科研质量评价体系关键要素（分高分低区别）

1.IDEA 的创新性

表现在主变量与表型、疾病的原创关联，以及主变量与机制因变量的原创关联，满足这两点， 创新性上就没问题

2.数据的逻辑层次

逻辑 12 宫图的
第一层是单变量代入五恒量，每篇文章都有变量，至少是单变量，哪怕是单变 量课题也可以用表型的嵌套来增加层次感，比如缺氧套转移、自噬套耐药，把一种表型当作 解释另一种表型形成的原因。

第二层是变量组合形成间接机制，多元变量组成的因 果关系是文章复杂性的主要来源。

第三层是分子交互构成的直接机制，这里除了分 子直接结合，还有修饰剪切的横纵嵌套模
式，有两种增加层次感的手段，可以叠加使用。横纵嵌套也有因果逻辑，上游变量是驱动纵向展开的要素，纵向展开也会影响下游变量环节以 及表型环节，构成一个严密的逻辑链条。

第四层是细胞交互，或者称为细胞嵌套， 把多元变量、间接或者直接机制再放到一个从哪里来到哪里去的空间场景里，进一步充实故 事情节，增加了合成、分泌、运输、识别、摄入、效应这些环节，里面每一步都有具体的作 用机制可以延展，形成宏大的世界观架构。表型嵌套、变量组合、分子交互、横纵嵌套再加 上细胞交互，5 层逻辑嵌套大满贯的文章起码是 10 分的底子

3. 数据的严谨性

生信数据挖掘，组织、细胞、分子、动物、生信五个维度，这些不同维度的数据是相互印证， 在说明同样的问题。

组织表达有差异，跟预后有关系，说明分子介导的功能可能与疾病发生 发展有关。

细胞模型上过表达或者沉默观察到表型变化证明分子确实影响表型，动物实验一 样还是验证分子与表型的关系。

组织来源的、细胞来源的、动物来源的，我们基础科研一共 就只有这三种数据的来源，分子和生信是可以归入细胞和组织来源的：分子来源于细胞实验， 而数据挖掘挖的是别人的组织标本检测结果。

image.png