gff to cds/pep

2020-09-09 本文已影响0人一直想要成为大牛的科研狗

已有基因组序列和gff3文件如何获得相关的cds和pep序列

# conda上安装cufflinks
# 根据gff提取cds
gffread in.gff3 -g ref.fa -x cds.fa
# 根据gff获得pep
gffread in.gff3 -g ref.fa -y pep.fa