docker版ubtuntu的使用

一 起因

有些开源软件需要编译程序，改变系统环境，从而实现其对应功能。然后，当系统环境改变之后，笔者运行的其他程序可能会受到影响，进而需要重新调整（无用的折腾）。因此，笔者建议这种程序还是在docker中运行更为方便，特别是当你对软件进行测试的时候。

二 调用

第一步，安装docker。这一部分读者可以参考之前的推文《docker初探》

第二步，安装ubuntu镜像

docker pull ubtuntu

第三步，更新docker ubtuntu的镜像源。原有的镜像源不包含对应的系统级层面的软件安装，需要重新更新，之后便可安装诸如g++, git, vim之类的编译依赖包

apt-get update

第四步，安装git选项

apt-get install git

第五步，调用git选项下载包。可以看出这里需要编译。

git clone https://github.com/xgfs/verse.git

apt-getinstall make

第六步，编译依赖的安装。如果未进行ubtuntu源的更新，那么g++和vim之类的依赖程序都无法安装安装上

apt-get install g++

apt-get install vim

第七步，将本地的目录挂载上。值得注意的是，docke镜像还需要将需要的特定目录挂载上，这样你才能一方面享受docker的隔离环境，另一方面又能在本地环境中实现数据的docker解析

run --rm --gpus all -i -v /mnt/sda5/wangjun/docker_catalog:/home/docker_catalog -t ba6acccedd29 /bin/bash

最后一步，完成上述这些之后，你就可以愉快的使用docker完成程序运行啦。

三 惯例小结

虽然docker运行起来较为折腾，然而这种容器的出现使得我可以随心所欲的测试新的程序，而不用担心破坏或污染系统环境，导致之前重要的程序需要重新折腾运行（要相信一点，能运行一次的程序一定能够运行第二次，只是在系统环境改变后需要折腾）。也希望笔者能够通过本公众号了解docker后开心的进行程序开发。

PS：下一期或许会汇总一些我知道的比较好的招聘信息，大家可以关注。

另外，进一步推广一下我开发的相关软件，Multi-omics Hammer软件和Multi-omics Visual软件，也欢迎大家关注并多提意见，详细的话可以见个人主页介绍。

以下为自研软件地址：

Multi-omics Hammer软件地址：https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer

Multi-omics Visual软件地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual

四 封面图