ggplot集锦

利用R语言分析基因表达量和临床特征之间的关系

2019-03-03  本文已影响0人  mayoneday

第一步:利用网页工具得到相关数据

网页工具:cBioPortal

微信截图_20190303223559.png 微信截图_20190303223638.png
微信截图_20190303224111.png

第二步:利用R语言画图

1.读取数据

a=read.table('plot.txt',
             sep = '\t',
             header = TRUE,
             fill=T)#读取数据
library(ggstatsplot)
ggbetweenstats(a, x=Tumor.Stage.2009, y=SOX9..mRNA.expression..all.genes.)
#加载R包后利用R包画图
#该图以Tumor.Stage.2009列数据为X轴
#SOX9..mRNA.expression..all.genes.列数据为Y轴
Rplot.jpeg
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