GFF文件转化为GTF并用于featureCounts计数

2024-10-16  本文已影响0人  嘿嘿嘿嘿哈

有时候进行比对的物种没有GTF文件,需要转化GFF为GTF文件才能用于featureCounts计数,这时需要用到gffread这个软件,进行以下操作:

conda install -y -c bioconda gffread
gffread genomic.gff -T -o genomic.gtf

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