GFF文件转化为GTF并用于featureCounts计数
2024-10-16 本文已影响0人
嘿嘿嘿嘿哈
有时候进行比对的物种没有GTF文件,需要转化GFF为GTF文件才能用于featureCounts计数,这时需要用到gffread这个软件,进行以下操作:
conda install -y -c bioconda gffread
gffread genomic.gff -T -o genomic.gtf
有时候进行比对的物种没有GTF文件,需要转化GFF为GTF文件才能用于featureCounts计数,这时需要用到gffread这个软件,进行以下操作:
conda install -y -c bioconda gffread
gffread genomic.gff -T -o genomic.gtf