R函数之merge（一）

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使用merge()函数读取数据：

class1_fence <- merge(X = fence, Y = class1_norm, 
                                  by.x = 'SampleID' , by.y = 'SampleID' ,all.x = TRUE)
Error in as.data.frame(x) : argument "x" is missing, with no default

试了多种方法，总是提示这个问题，最终解决。

class1_fence <- merge(x = fence, y = class1_norm, 
                                  by.x = 'SampleID' , by.y = 'SampleID' ,all.x = TRUE)

原来R是大小写比较敏感的！

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继续操作，结果如下：

class1_fence <- merge(x = fence, y = class1_norm, 
                                 by.x = SampleID , by.y = SampleID ,all.x = TRUE)
Error in fix.by(by.x, x) : object 'SampleID' not found

试了一种方法解决。

class1_fence <- merge(x = fence, y = class1_norm, 
                                 by.x = 'SampleID' , by.y = 'SampleID' ,all.x = TRUE)
Error in fix.by(by.x, x) : object 'SampleID' not found

为什么会是这样呢？
出错提示，object 'SampleID' not found，因为SampleID不是一个对象，是一个变量，所以得用引号括起来！

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继续操作，结果如下：

merge(x = name, y = class1_norm,
 by.x = 'SampleID' , by.y = 'SampleID' ,all.x = TRUE)

Error in fix.by(by.x, x) : 'by' must specify a uniquely valid column

数据中的SampleID是一个实实在在存在的数据，极有可能是因为x没有读入的原因，于是我试了试

 merge(x = get(name), y = class1_norm,
 by.x = 'SampleID' , by.y = 'SampleID' ,all.x = TRUE)

结果大功告成！
上式中的get()将字符串转换为对象。

今天就分享到这里，后会有期。