DSS
2019-08-08 本文已影响0人
毛桃mt
1.1 DSS的优势:可以处理没有重复的数据。它可以通过smoothing,将邻近的cpg位点作为假设的重复。
1.2 DSS找dmr的关键参数:
delta: 两组比较,显著差异区域的阈值。delta可以为0.1或者0.2, 可以计算出每个位点具有显著差异的概率值posterior probability (pp)。
p.threshold: 当1-pp < p.threshold时,可以定义该位点为显著差异位点。
1.1 DSS的优势:可以处理没有重复的数据。它可以通过smoothing,将邻近的cpg位点作为假设的重复。
1.2 DSS找dmr的关键参数:
delta: 两组比较,显著差异区域的阈值。delta可以为0.1或者0.2, 可以计算出每个位点具有显著差异的概率值posterior probability (pp)。
p.threshold: 当1-pp < p.threshold时,可以定义该位点为显著差异位点。