生信星球培训第十五期

DAY3-麦小癫

2019-05-08  本文已影响4人  林大可爱

学习心得[引自生物星球]

  1. 检查软件
    Linux输bzip2
  2. 安装bzip2
    Linux输yum install -y bzip2
  3. 下载miniconda
    miniconda官网,复制链接,下载
    https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  4. 复制
    cd biosoft进入biosoft,wget复制,下载。
  5. 安装
    bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  6. 激活
    source ~/.bashrc激活conda
  7. 添加镜像

conda config --add channels r
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

  1. 查看当前所有软件列表 conda list
  2. 搜索软件 conda search fastqc【这里以数据质控软件fastqc为例】
  3. 安装软件 conda install fastqc -y 【加上-y是自动安装,你可以试试不加-y有什么区别】
  4. 卸载软件 conda remove fastqc -y
    image.png
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