SP-SingleCell单细胞测序

2022空间转录组分析01:stLearn CCI分析教程数据说

2022-02-22  本文已影响0人  信你个鬼

教程链接:https://stlearn.readthedocs.io/en/latest/tutorials/stLearn-CCI.html

教程更新速度太快,很多网络上的帖子已经不能运行了,官网教程的数据又没有提前交代。。。还没开始学习就遇到了两个坑。。。
此教程数据在:10X官网

image-20220222115359259.png image-20220222115542672.png

space ranger 1.1.0与1.0.0区别:spot数不一样,官方教程采用的是1.0.0,V1_Breast_Cancer_Block_A_Section_1/的spot数为3813个

image-20220222115721000.png

教程中的label_transfer_bc.txt数据在:https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/tree/master/tutorials

关于label的来源,可见:https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/issues

上一篇 下一篇

猜你喜欢

热点阅读