2022-09-26 TIMER数据库
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千容安
TIMER:计时器2.0 (comp-genomics.org)
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![](https://img.haomeiwen.com/i27100867/2ecce1a0b7071562.png)
要用tpm标准化的数据。一开始用RNA-seq的数据,会报错,就从GDC下载了肿瘤的数据。后来发现上传RNA-seq时选择小鼠就能加载成功了。
GDC的数据得到tsv(其中一个样本)如图:
![](https://img.haomeiwen.com/i27100867/bb08f914ecc4fc36.png)
取箭头这列,把样本的这列放在一起作为输入文件。