单细胞笔记22-分享两篇深度分析scATAC-seq计数矩阵方法

2024-01-22  本文已影响0人  江湾青年

对于fragment counts建模可改善单细胞 ATAC-seq 分析(而非read counts/binary counts):

https://www.nature.com/articles/s41592-023-02112-6

提出了改进scATAC-seq counts matrix的PIC方法,能够提供对scATAC-seq更准确的定量矩阵,并改进下游分析

https://www.nature.com/articles/s41592-023-02103-7

方法链接:https://github.com/Zhen-Miao/PICsnATAC

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