Python安装(Windows+Linux)

2023-07-04 本文已影响0人 Biomamba生信基地

写在前面

熟悉Biomamba的同学都知道，我是一个忠实的R语言爱好者，我们的单细胞教程大多是基于R语言依赖的package制作的(这主要是因为R语言的可视化能力真的很强大)。但由于生信分析数据量的不断增大，R语言吃硬件、低效的特点逐渐让我难以忍受(SCENIC点名吐槽)。以及Biomamba最近发现空间转录组的相关工具依赖于Python的作品居多，因此开启了一段Python学习的旅程。区别于我们以前的课程，本系列Python分享面向的是与我一样有其它编程基础的同学，对于真正对编程零基础的同学来说，可能无法做到"手把手"。本系列内容适合各位在详细学过Python后用于查阅Python常用内容，并检查自己所掌握知识点的牢固程度。Python的详细教程有很多，这里我推荐跟着这个视频详细学习一番:
https://www.bilibili.com/video/BV1qW4y1a7fU/?p=65&spm_id_from=pageDriver&vd_source=6335356a0d3631ad476b7c7de83892db

一、Window下Python的安装

1、安装

替大家下载好了安装包：
http://biomamba.com:34080/free.download/Python/python-3.10.4-amd64.exe

大约30s后完成安装过程，不同设备安装速度有所差异：

2、验证

（1）终端调用
点击键盘的Windows键，输入"cmd"，回车键打开

在弹出窗口中输入"python"能够成功返回Python界面

(2)直接打开python解释器：
点击键盘的Windows键，输入"python"，鼠标点击Python 3.10

可以成功返回python的界面，即为安装完成：

二、Linux下python的安装

需要在Linux当中学习python的同学需要先拥有linux基础，大家可以根据超链接跳转学习：

往期回顾

源码安装有些麻烦，还是建议通过conda安装：

(1)conda安装

1、安装conda：
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh 
#安装conda，出现选项选yes

安装过程一直敲回车、遇到询问均填写yes后敲击回车即可，安装时间需要花费5~10分钟，如果选择安装 Microsoft VSCode部分，会额外花费一部分时间。

 source ~/.bashrc#重启一下环境配置，否则无法直接定位到conda
which conda#返回完整路径即为安装成功

（2）添加镜像

#添加一些镜像
conda  config --add channels defaults
conda  config --add channels conda-forge
conda  config --add channels bioconda
#增加bioconda，方便安装生信软件

#最近阿里的镜像似乎比较稳定：
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/bioconda/

（3）python安装

conda search python#检索python版本

会返回许多python对应的版本：

我们下载3.10.4版本：

conda install python=3.10.4
#如有询问输入y后回车即可

（4）安装校验
在终端中输入

which python#能够显示完整路径
python#能够成功进入python编辑器

三、查看python是否可以运行

在以上的各个平台打开的python，输入命令：

print("hellow Biomamba")

以下为Linux中的演示结果：

到此，大家就完成了Python的安装与校验啦，后续分享敬请期待~

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