figtree 简洁好用绘制进化树 | 生信分析常用GUI软件介

不时，我们手上会拿到一些进化树或聚类树文本，往往是 newick 格式，比如

(((A,B),C),(D,E));

其中记录了不同单元的关系远近。可视化进化树，可以让我们更直观地进行分析。可选的软件有很多，但其中最简单便捷的，那么是 Figtree。

Figtree 的安装与配置

Figtree 是一个 Java 软件，只要系统环境中可以找到 JVM ，那么就可以直接执行。
相关程序安装包已上传过到公共仓库，请自行下载。

进入Figtree文件夹

解压对应zip压缩包即可

找到可执行文件，双击即可运行

Figtree 的简单使用

直接从File 菜单导入进化树，可以导入前述构建的 AtARF.pep 的 NJ 树。

剩余内容调整其他

一般按照自己需要进行摸索即可，实际并不需要什么教程

写在最后

figtree 或许是目前我见过最简单简洁的进化树可视化软件，没有太多废话，自然也没有那么丰富的功能。有时候，核心功能就够用了。
当然，主要原因是，这个软件本身其实只是配套来可视化另一个软件的进化树输出结果。我想，作者真没把这个软件当回事，但是这个软件，真的好用。
至于共享软件仓库，请参考

https://tbtools.cowtransfer.com/s/97e50e9f762d44