生物信息学与算法生信猿生物信息学从零开始学

Linux 系统基本操作

2019-03-25  本文已影响10人  熊猫人和熊猫猫

1.认识Linux系统

Linux不同于Windows下有C盘、D盘等等,它呈树状结构,从根目录“ /”开始。

2.Linux基本操作

2.1 认识Linux命令

2.2 Linux命令 之 目录

2.3 Linux命令 之 文件

2.4 其他操作命令

2.5 系统自带的帮助信息

3.了解Linux 权限

Linux的权限结构由三大类权限组成:文件拥有者、拥有者所在的组、其他组权限。
每一类都有三种权限组成:只读(r=4)、可写(w=2)、执行(x=1)

4.软件安装

$ tar -zxvf ab.tar.gz 或者  tar -jxvf ab.tar.bz2 #解压文件
$ cd ab #进入文件夹
$ ./configure [-prefix=] #配置安装环境
$ make #安装
$ make install

5.环境变量

定义:指定操作系统运行环境的一些参数
在linux里,我们一般会指定PATH环境变量,以使我们的程序能够更好的运行

5.1 设置环境变量:

5.2 环境变量的读取顺序

5.3 对命令设置别名

eg: 通过catch命令实现 [filename] 的排序和去重
(1).bashrc 文档中添加 alias catch='cat [filename] | sort | uniq' ;
(2)更改文件后,使用 source ~/.bashrc 命令使得环境变量刷新

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