linux环境下的软件下载与安装

由于linux是一个单界面指令操作软件，因此下载与安装也需要相应指令进行操作

minicoda

mincoda相当于appstore，用于下载，管理各类软件

minicoda的下载与安装

mincoda下载

wget +下载链接

mincoda安装

bash +软件名称.sh

mincoda激活

source ~/.bashrc

使用minicoda下载与安装软件

搜索软件

conda search 名称

下载软件

conda install fastqc -y(-y为自动安装/卸载)

安装软件

conda remove fastqc -y(-y为自动安装/卸载)

conda 环境？

我暂时认为的conda环境是指在linux系统下通过conda功能性的建立一个一个的子集，这些子集互不干涉。我认为conda环境类似于不同的自然环境气候，我们使用不同类型及版本的软件构建一个个子集，用于我们进行不同的分析，比如我们分析狮子的时候，需要在热带草原气候下分析，分析鲸鱼的时候，就要在海洋中分析。我们使用不同的单元，比如水，海水，树，草构建不同的子集，以适用于我们不同的需求。
而对基础的conda base环境，对应的就是地球生物圈了。
因此得知，生物信息分析可能会需求不同软件的组合以达到分析的可信性。因此需要多阅读生信的类的文献，了解最新的分析策略了。我们在尝试开始进行生信分析的时候，应该要了解最新的公认的分析策略，如果想要更好的应用，就需要了解这些策略与之前相比有什么优越性，并关注其缺点和以后的发展趋势，以便于循序的更新策略，增加自己分析结果的可靠性。