生物信息学

linux 命令行运行R脚本

2019-12-18  本文已影响0人  西贝_贾

1. Rscript a.R

2. R CMD BATCH a.R

3. 编写脚本是第一行加入Rscript的路径,如

#!/usr/bin/env Rscript

sayHello <- function(){

  print('hello')

}

然后在终端运行该脚本

sayHello()

4. 运行一行命令

R -e 'install.packages(c("package1", "package2"))' # install to default location.

sudo R -e 'install.packages(c("package1", "package2"), lib="/usr/local/lib/R/site-library")' # install to location that requires root.

安装包到全局

sudo su - -c "R -e \'install.packages(c("package1", "package2"))\' "

此处的 -e 参数是 expr 的意思

上一篇下一篇

猜你喜欢

热点阅读