基因编辑的新工具—Prime Editing
CRISPR系统为代表的基因编辑工具发展迅猛被广泛应用。基于CRISPR/CAS9系统开发的新的先导编辑系统(Prime editing, PE)也逐渐引起人们的关注。PE是David Liu实验室于2019年开发的精准基因编辑系统,其最大的优势在于多样的编辑类型,包括多位点(Multiple sites)编辑、DNA短片段插入和缺失(<100bp)。相比于传统的HDR(Homologous Directed Recombination),PE无需DSB(Double Strand Break)即可实现编辑,因此更加高效、安全。同样PE也存在其限制条件,包括(1)较低的编辑效率(2)pegRNA设计相对困难(3)PE的递送问题等等。
2021年10月14日,美国哈佛大学David Liu实验室与普林斯顿大学Britt Adamso实验室合作在Cell杂志上发表了题为Enhanced prime editing systems by manipulating cellular determinants of editing outcomes的论文,给出了关于PE系统的进一步解决方案。
PE系统原理
PE2: 将经过改造的向导RNA(pegRNA)与prime editor蛋白相结合,pegRNA具有双重功能,既能够将编辑蛋白引导到目标位点,又含有编辑的模板序列。prime editor蛋白则由Cas9切口酶和逆转录酶融合而成。在Cas9切割目标位点之后,逆转录酶以pegRNA作为模板进行逆转录,然后将DNA直接聚合到切口的DNA链上。
PE3: 在PE2系统基础上添加一条sgRNA,会在另一条未切割的基因组单链上造成一个缺口,增加重组的概率。
PE4&5:在2021年的研究中,分别在PE2和PE3的基础上通过共转染MLH1dn抑制DNA错配修复(MMR)通路从而有效增强PE系统的基因编辑效果。
功能验证
PE系统在293T上的验证,表现出与传统CRISPR系统的特点:较高的编辑效率,较低的非预期编辑
总体而言,Prime Editing展现出在基因编辑领域美好的前景,也为疾病的基因治疗提供了更加强大的工具。