Shell 命令学习
2022-07-11 本文已影响0人
纵纵纵小鸮
统计某字符出现的次数：
grep -o "bismark" SIM14-1check.txt | wc -l
读取文件中的每行并输出：
while read line
do
echo $line
cat $line*"CX_report.txt" > $line"_allreport.txt" ###合并同一类型文件
done < uniqsample.txt
去除文件中重复的行：
sort -n allsample.txt | uniq > uniqsample.txt
遍历文件夹中某一类型文件并删除文件前缀及后缀：
for file in ./*.CX_report.txt
do
short=${file##*/} ##删除前缀“##”
sample=${short%%_R_clean_1_bismark*} 删除后缀“%%”
echo $sample >> allsample.txt
done
