生信星球培训第四十九期

Day 6 letitgo R包学习

2020-04-05  本文已影响0人  letitgo_1ddf

一 镜像设置:

1.options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置

options("respo" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))#对应清华源
options(BioC_mirror="http://mirrors.utsc.edu.cn/bioc/")#对应中科大源
当然可以换成其他地区的镜像,这种方法有可能每次运行Rstudio都需要重新运行一次镜像代码## 2.查询镜像设置
        options()$repos:查询CRAN 镜像设置
        options()$BioC_mirror:查询Bioconductor

3. 设置固定镜像-.Rprofile固定镜像

是一个代码文件,刚开始运行Rstudio的时候,程序会查看许多配置内容,如果启动时找到这个文件,那么就替我们先运行一遍(这个过程就是在启动Rstudio时完成的)

用file.edit()来编辑文件
首先file.edit('~/.Rprofile')
#然后在其中添加好两行options代码:
c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.utsc.edu.cn/bioc/")
最后保存=》重启Rstudio,这时你再运行一下:options()$repos和options()$BioC_mirror 就发现已经配置好了
以后每次启动Rstudio不用再设置镜像

二 R包安装

CRAN 网站的R包:install.packages(R包名称)
Biocondutor下的R包:BioManager::install(R包名称)

三 R包加载

library(R包名称)
require(R包名称)
二者任一个都可以

四 dplyr包学习:

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #设置CRAN镜像
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #设置bioconductor镜像
install.packages("dplyr")#安装dplyr包
library(dplyr)#加载dplyr

五 在Rstudio中进行dplyr练习

Rstudio具体操作.png

六 全部总结如下:

R包dyplr学习.png
总结:还是多进行练习,然后才能够真正的掌握R的运用,接下来会自己跟着书本进行常见R包的练习。通过此次的课程发现,R也不是那么可怕,那么难,还是有章可循的。千万不能偷懒!!
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