生信生物信息学

Excel在生物信息分析中的骚操作(3)——VLOOKUP

2020-01-24  本文已影响0人  医学小蛋散

前言

就是Excel那么low!

现在有两个表格:

两个表格

今天有一个任务,就是要根据两个表格中的“GENEVA_ID”一列,把表一中的SEX一列,“填到”表2中的SEX一列中(因为这个表格提供的信息是不对的)。

第一步:首先将它们放在一起。

把两个放在一起

第二步:移动两列数据

如图移动两列数据

第三步:使用VLOOKUP

函数:=VLOOKUP(E2,F:G,2,FALSE)

人话:记得双击右下角的十字符号哦,不要下拉万多列哦~

第四步:去掉原来数据的两列及Sex那一列

去掉不要的数据

第五步:整理数据:

整理成想要的样子

完成!~

后记

本操作其实是为了进一步分别提取男性和女性的famid ID和 Individual ID如下:

一切都是为了keep的操作做准备

那就根据sex这一列,排序就可以了:

排序后,分别提取1和2的数据,保存成想要的样子

大功告成~

这就是想要的样子了

这就是单纯提取女性的2号染色体数据的plink命令了~

plink --bfile chr2 --keep females.txt --recode --out females_chr2

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