课前准备---空间邻域差异分析

2025-07-25  本文已影响0人  单细胞空间交响乐

作者,Evil Genius

今天我们需要准备的是空间细胞邻域差异分析

前面的内容讲过了高精度(Xenium)的注释、niche、邻域,那么接下来就是邻域差异分析。

关于邻域差异分析,有两种,

第一种,特定的细胞类型周围相比于其他区域显著富集的细胞类型,如下图


第二种,不同样本间某些特定区域的细胞邻域差异

当然了,两者都非常重要,我们都来实现一下,注意前面的工作要做完整

首先第一种,比较简单

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