生信星球培训第八十四期

Day1-君君

2020-10-12  本文已影响0人  喵喵喵_dadb

RNA高通量测序(RNA-seq)

定义

RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA和NONcoding RNA等或者其中一些,用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围:

  1. 检测所有mRNA表达量的差异(最常见)。
  2. 检测RNA的结构上的差异,例如剪接方式的差。
  3. 基因单点突变导致的SNP

方法原理

测序方法

[测序流程]


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原理

先去除保守的rRNA ,→polyA 尾的特性,用磁珠吸附→Mg镁离子溶液打断mRNA→随机引物变成双链合成第一条cDNA(由RNA变成单链DNA)→再合成第二条DNA(双链DNA)→用相应的酶切加上A,加上Y 行接头(adaptor)。

[原文链接]
(https://www.jianshu.com/p/923d0453a365)

数据分析

数据分析可以说是RNA-seq的重中之重!包括质量控制、读段比对、基因和转录本定量、差异性基因表达、功能分析、基因融合检测、eQTL图谱分析具体后面再学习啦,补点代码:

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//  xxxxxx.h
//  bookclub
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//  Created by youhui on 2018/11/21.
//  Copyright © 2018年 luke.chen. All rights reserved.
//
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 功能:
 用来解决vc生命周期已经执行,但是却被其他图层挡住,导致无法准确的拿到页面“可见化”的时机
 通过传入target 在debut、each 两个block中可以分别拿到首次、每次的“可见化”回调

第一天作业结束啦,辛苦花花🌹

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