TCGA-CESE（早期宫颈癌）临床信息数据下载
2020-02-15 本文已影响0人
养猪场小老板
- 1）打开bing搜索https://cn.bing.com，输入GDC TCGA回车https://portal.gdc.cancer.gov，跳转到TCGA数据库的官网；
bing_GDC TCGA.png
TCGA官网.png
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2 ) 在搜索框中输入CESC，选择下拉中跳出的TCGA-CESC，点击进去
输入CESC.png
进入TCGA-CESC.png
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3 ) 跳出网页后，选择miRNA-seq，点击“307”cases，再跳转；
miRNA-seq.png
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选择第一行的该数据，再点击进去；
image.png
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5 ) 跳转出来的页面发现，与临床信息有关的文件有10个，点击进去；
clinical
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6 ) 跳出的界面，选择clinic patient的信息，并点击进去；
clinic patient.png
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7 )跳出来的页面，显示有10个病人信息case，在上面点击download下载；
image.png
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8 )点击的下载得到的数据是一个压缩包” gdc_download_20191101_014445.344546.tar”
压缩包.png
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9 )解压，挑出其中的nationwidechildrens.org_clinical_patient_cesc.txt文件
image.png
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10 )将nation文件先用editplus软件或者notepad++打开，然后复制到excel中，将第一和第三行删除；并选择合适的列宽
image.png
