Day3——youwanwan39

今天的学习内容其实不难，但我也犯了一些小错误。

Conda

Conda是Linux的应用商店。
生信用miniconda就可以了。

Miniconda3安装包

下载了上图的版本，一开始下载错了，用了mac的版本，我说怎么一直报错呢。。。

conda环境 相当于有不同的分身，即不同的“conda environment”，可以安装不同的软件或者相同软件的不同版本以满足不同项目的需要。

相关命令

uname -a 查看服务器是多少位的
cd ~/biosoft 进入biosoft文件夹，将软件下载到这里【tab键：自动补全】
wget 下载链接 下载
sh是脚本文件的后缀，脚本即一个程序，是后台的代码。
bash 安装包名字 安装
source ~/.bashrc →conda 激活conda
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes 添加镜像
conda list 查看当前服务器上安装的所有软件列
conda search fastqc 搜索conda软件
conda install fastqc -y 安装软件【-y表示后面的问题都回答yes】
conda remove fastqc -y 卸载软件
conda info --envs 查看当前conda环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y 建立一个名叫rna-seq的conda环境
conda activate rna-seq 激活新的conda环境
conda deactivate 退出当前环境