德国癌症研究中心发现一种新的直肠癌术后预测方法
一项刊登在影响因子17杂志Gut上题为“Genome-wide DNA methylation analysis reveals a prognostic classifier for non-metastatic colorectal cancer (ProMCol classifier)”的研究报告中,来自德国癌症研究中心的科学家们发现,ProMCol分类器可以提高非转移性CRC患者的预后准确性。
用于预测结直肠癌(CRC)患者生存率的病理分期仅提供有限的信息。
对此,研究者对两组非转移性CRC患者(筛查组(572人)和验证组(274人))进行了DNA甲基化全基因组研究。筛选队列采用Cox模型的边缘检验对预后CpG位点进行变量筛选,并以34对肿瘤与正常黏膜组织甲基化差异作为辅助协变量,通过独立假设加权调整p值。在1000个调整后p值最小的CpG位点中,选择20个总体生存率(OS)最小的CpG位点。应用主成分分析,他们得出了一种基于预后甲基化的非转移性CRC患者分类器(ProMCol分类器)。
该分类器与筛选中的OS (HR 0.51, 95% CI 0.41 - 0.63, p=6.2E−10)和验证队列(HR 0.61, 95% CI 0.45 - 0.82, p=0.001)相关。ProMCol分类器的独立验证显示,3年OS的预测误差从仅使用标准临床变量计算的0.127,减少到结合临床变量和分类器计算的0.120,4年OS的预测误差从0.153减少到0.140。所有结果都证实了疾病特异性生存。
筛查(A)和验证(B)队列的临床病理学特征
ProTOCol分类器中包含的20个CpG位点的特征
Promcol分级器的多变量Cox回归分析
预测误差曲线和曲线下面积的总体存活率
Kaplan-Meier总体生存图
Cox回归分析的探索性复制分析
来源:Genome-wide DNA methylation analysis reveals a prognostic classifier for non-metastatic colorectal cancer (ProMCol classifier).Gut
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