数据库数据库

[NAR|2019] SimpleClinVar 临床相关突变研

2019-07-25  本文已影响3人  drlee_fc74

ClinVar 数据库是ncbi旗下用于查看临床相关突变的数据库。但是其数据库的内容比较多,而且检索界面不是很友好。所以经常看不懂其结果。 Simple ClinVar通过其名字我们就知道这个是一个简易版的Clinvar数据库。

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输入

数据库的输入很简单,我们可以数据疾病基因名; 突变等。都可以。我这里输入gastric cancer

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输出

文章的结果包括三个部分,我们可以看到和这个疾病相关的gene; variants; phenotype

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我们点击每一个都可以看到详细的结果。例如点击genes就可以看到三个相关的突变基因都是哪三个了。

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另外数据库也提供了下载的功能。我们点击Show Table就可以看到其下载结果的地方了。

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PS:数据库里面的内置数据是2019.5的。这个数据不知道会不会定时更新。如果不更新的话,那过一段时间可能结果就不是很新了。所以这个数据库的使用,还是取决于更新的速度呀。。

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