科研工具 | 本地远程使用服务器的Jupyter Noteboo

2018-09-29 本文已影响0人与阳光共进早餐

一、写在前面

未经允许，不得转载，谢谢~~

很久没有更新博客了ヾ(◍°∇°◍)ﾉﾞ

这篇主要是关于科研中对于用本地电脑远程使用服务器上面的Jupyter Notebook的配置记录。

我们都知道Jupyter Notebook是一个很好用的交互式的代码编辑器，可以支持python、markdown等多种语言，特别是对于处理实验结果非常有帮助，但是服务器由于没有图形界面，而为了避免本地机器也要配置相关环境以及文件同步的烦恼，我们就可以配置远程使用服务器上的Jupyter Notebook，就是素有实际的程序运行都在服务器端，但界面显示在本地。

二、具体配置过程

1. 安装Jypyter Notebook

在服务器上安装，本文用conda的方式来管理；
执行指令：conda install jupyter
安装完成后查看版本：jupyter --version
能成功看到版本号就安装成功啦~~

2. 生成配置文件

执行指令:jupyter notebook --generate-config
如下所示：
可以看到配置文件的名字为：jupyter_notebook_config.py，后面需要再配置这个文件；

3. 生成秘钥

打开python3
输入：

from IPython.lib import passwd
passwd()

然后设置密码之后会得到一组生成的秘钥
把生成的秘钥复制下来，'sha1:8ab8caa21bff:bc891ca676530bedc0dc7f7c545ae610b01e45fd'

4. 修改默认配置文件

这个时候就需要修改之前第2步中的配置文件了；
在终端输入：vim ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py, 对文件进行编辑；
在文件末尾添加以下语句：

c.NotebookApp.ip='*'
c.NotebookApp.password = u'sha:ce...刚才复制的那个密文'
c.NotebookApp.open_browser = False
c.NotebookApp.port =8889
c.IPKernelApp.pylab = 'inline'

其中，c.NotebookApp.port =8889中的端口号可以随意指定；

5. 服务器端启动jupyter

终端输入指令：jupyter notebook
如下所示：
可以看到给出的提示：
The Jupyter Notebook is running at: http://[all ip addresses on your system]:8889/
即在本地机器使用http://[all ip addresses on your system]:8889/即可访问服务器上的jupyter程序

三、使用效果

如下所示：
这样每次都可以再本地打开了。
使用之前会放你输入之前设置过的密码；
另外运行之前需要在服务器上启动jupyter程序；

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四、 jupyter 选择conda虚拟环境

需求所在
我们可能需要配置多个虚拟环境来运行自己的程序，那怎么样在虚拟环境在运行jupyter notebook呢~
操作步骤
- 激活对应的虚拟环境：source activate 环境名称
- 安装conda install ipykernel;
- 将环境写入notebook的kernel中: python -m ipykernel install --user --name 环境名称 --display-name "Python (环境名称)"
- 然后打开notebook：jupyter notebook
- 然后把对应文件的kernel---> change kernel修改一下，改成刚刚配置好的。（这一步折腾了好久才发现(⊙o⊙)…）
- 这样就可以啦

五、参考文献

非常感谢以下博主的文章：