生信星球培训第八期

学习小组Day4笔记-梦幻天堂

2018-10-25  本文已影响92人  梦幻天堂_ccd5

R语言初步学习

准备工作

Snipaste_2018-10-25_15-17-34.png
如果不是可以点这里参考教程修改。很麻烦。

已经下载过了,为了更好的学习,R卸载了再装一遍。

  1. 打开链接
  2. 点击download R for windows
  3. 点base
  4. Download 3.5.1版

安装Rstudio。点这里链接。网速很慢。太慢了,要一个小时,还是用原来的旧版本吧。

Rstuio的基本操作

  1. 调整了镜像和外观


    Snipaste_2018-10-25_16-01-29.png

不知道重装以后我以前下载的包还在不在。。。

  1. 认识Rstudio界面,借用生信星球图片


    Snipaste_2018-10-25_16-07-08.png
  2. 做一个简单的图
    plot(runif(50))

plot()函数是R中基本的画x-y两个变量的函数,其用法如下为:plot(x, y, ...)
runif()函数可以产生两列随机数:x1,y1。。。

plot(runif(50))就是对runif产生的50个随机数画图

Snipaste_2018-10-25_16-20-45.png
对plot函数加入了一下参数作图
> plot(runif(100),main = "基因表达",xlab = "基因",ylab = "表达",xlim = c(0,100),ylim = c(0,100),col = "red",pch = 19)
Snipaste_2018-10-25_17-53-13.png

结果全是水平点,奇怪了。搜索runif用法发现

R语言生成均匀分布随机数的函数是runif()
句法是:runif(n,min=0,max=1) n表示生成的随机数数量,min表示均匀分布的下限,max表示均匀分布的上限;若省略参数min、max,则默认生成[0,1]上的均匀分布随机数。

设定了范围重新作图
plot(runif(100,min=0,max=100),main = "基因表达",xlab = "基因",ylab = "表达",xlim = c(0,100),ylim = c(0,100),col = "red",pch = 19)

Snipaste_2018-10-25_17-53-52.png
  1. 查看工作目录
    getwd()
  2. 设置工作目录
    setwd()
    Snipaste_2018-10-25_18-05-59.png
  3. 显示文件列表
    list()或者dir()
    list()命令无显示,忘了打file,加上file还是无显示,忘了打files,原来必须加s
    Snipaste_2018-10-25_18-10-16.png
  4. 计算1加2


    Snipaste_2018-10-25_18-16-45.png
  5. 求和1-5 sum()
    Snipaste_2018-10-25_18-19-04.png
  6. 赋值
    <-或者=。=不常用
    Snipaste_2018-10-25_18-22-13.png
  7. 删除对象 rm(),显示剩下的变量ls()
    Snipaste_2018-10-25_18-31-55.png
  8. 列出历史记录
    history()
    列出最后10个
    history(10)
  9. 清空屏幕
    ctrl+l
  10. 保存记录
    save.iamge()

思维导图

Snipaste_2018-10-25_18-44-28.png

整个过程非常顺利,愉快的完成了今天的学习!

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