MEGA | 多序列比对
2021-08-27 本文已影响0人
生信师姐
功能1：序列编辑
- 首先，要讲一条使用mega打开序列文件的技巧:直接将要分析的文件拖到mega软件的图标上，然后就是下面这个界面了。
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- 在第一列选中序列名称，就可以对序列名称进行编辑，剪切和删除的修改。
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- 此外，点击Species/Abbrv，可以对序列按名称顺序进行排列，非常方便。
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功能2：序列比对
- 点击顶部功能栏的Alignment，一般选择下面的第一个，cluster w,也可以直接选择顶部一个大写 W 的快捷键，进行序列比对。
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- 接下来，软件会提示，没有序列被选中，是否选择所有序列，点击ok选择所有序列进行比对。
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接下来，会弹出一个参数设置的界面，我们一般不做修改，直接点击ok，进行下一步。
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- 之后，会出现下面这个界面，显示序列比对的进度。
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- 序列比对完成以后，我们可以通鼠标过拖动序列顶部来选中不同的列，进行删除，以达到截齐比对结果两端的目的（非必需步骤），大致就是这样。关于构建进化树的功能将在后面讲到。
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https://max.book118.com/html/2018/1101/6123030034001225.shtm
https://www.renrendoc.com/paper/99854631.html
https://jingyan.baidu.com/article/358570f6a48ce5ce4724fcf2.html
