单细胞转录组

猜一猜这个人类肺部器官单细胞研究会发在CNS吗

2019-12-30  本文已影响0人  因地制宜的生信达人

最近在bioRxiv 预印本发现了一篇人类肺部器官单细胞研究,来自于斯坦福大学团队,发表在Aug. 27, 2019; doi: http://dx.doi.org/10.1101/742320 有约7万个单细胞数据,找到了58个细胞亚群,其中大部分是前人研究发现过的,但是有14个新亚群。

作者的亚群信息都在Table S2. Human lung cell cluster identities and their abundances in each dataset.分别是:

前人定义的23种经典细胞类型中的7个 (ciliated, basal, alveolar type 2, capillary, bronchial vessel, myofibroblast, and fibroblast), 都被发现其实还可以进一步分群。

当然,本研究也使用了前面提到的 两个小鼠器官单细胞图谱 , 里面介绍的2018年其实在nature和cell分布发表了小鼠器官单细胞图谱研究数据,表达矩阵都是可以直接下载的,浙江大学的研究有小白鼠近50种器官组织的40余万个细胞,斯坦福大学的研究从小鼠20个不同器官中分离出超过10万个细胞测序。

上一篇 下一篇

猜你喜欢

热点阅读