samtools 报错：dyld: Library not lo

不知道什么时候开始，samtools 莫名其妙的出现了一个bug，之前一直用网上查的一个方法修复，但是经常反反复复地出现，今天终于发现这个问题发生的原因。

系统是Mac OS，samtools报错信息如下：

dyld: Library not loaded: @rpath/libcrypto.1.0.0.dylib
  Referenced from: /Users/mac/anaconda3/bin/samtools
  Reason: image not found
Abort trap: 6

网上查到的办法是重装openssl(1.0):

conda install openssl=1.0

之前这个方法屡试不爽，但是每次openssl升级之后就又有bug了，后来发现libcrypto.1.0.0.dylib这个文件在/usr/local/lib/下边，就查看了一下这个文件，发现它是一个软连接：

(base) mac@mac-2:~$ ls -l /usr/local/lib/libcrypto*
lrwxr-xr-x  1 root  admin  75 Jun 18  2019 /usr/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib -> /Applications/EasyConnect.app/Contents/Resources/Libs/libcrypto.1.0.0.dylib

然后就发现了问题的存在，软连接所指向的这个文件是不存在的：-（

(base) mac@mac-2:~$ ls /Applications/EasyConnect.app/Contents/Resources/Libs/libcrypto.1.0.0.dylib
ls: /Applications/EasyConnect.app/Contents/Resources/Libs/libcrypto.1.0.0.dylib: No such file or directory

既然这个软连接是空的，那就把它删了，重新创建一个不就得了吗？

(base) mac@mac-2:~$ rm /usr/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib
(base) mac@mac-2:~$ ln -s /Users/mac/anaconda3/lib/libcrypto.1.1.dylib /usr/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib

其实我发现不一定必须是libcrypto.1.0.0.dylib，好像更高的版本也可以，我这里就用了libcrypto.1.1.dylib。

这个方法不一定一劳永逸，因为我的openssl是conda安装的，很可能因为其他软件的依赖而被升级，这样这个软连接可能就又不能用了，想要可靠一点的话，就用brew去安装一个openssl，然后把libcrypto.1.0.0.dylib这个文件链接到/usr/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib就可以了，只要系统的openssl不升级就不用担心再出bug。