思路清奇SCI:09.p-EMT+肝癌(4.48分)

发表杂志：Journal of Cellular and Molecluar Medicine
PMID：33215860

知识点

1. HCCDB：包含15个常见的肝癌数据集
2. p-EMT：partial epithelial mesenchymal transition 部分EMT，是EMT的中间状态

科学问题

转移性细胞癌表达一定量的E-cadherin，而处于p-EMT状态的癌细胞具有强烈的趋势适应转移环境，具有更高的转移风险。探讨p-EMT相关基因与肝癌的关系。

整体思路

结果

1.mRNA周边

1.1 表达（N vs T）

Fig.1

1.2 预后

Fig.2

1.3富集分析

Fig.3

1.4 突变+PPI

Fig.4

2.ceRNA网络构建

2.1 miRNA

Fig.5

2.2 lncRNA

Fig.6

3.临床样本验证

Fig.7

感悟：

1. 整体思路比较清晰，围绕p-EMT相关基因的周边（表达、预后、突变和PPI），再加上ceRNA网络构建，和临床样本验证，相对思路比较完整。
2. 亮点：p-EMT
   参考链接：
   Comprehensive analysis of partial epithelial mesenchymal transition-related genes in hepatocellular carcinoma