TBtools攻略

为了让所有人都轻松完成「基因差异表达分析」.....

2022-07-20  本文已影响0人  生信石头

写在前面

在「基因差异表达」分析这件事情上,说实话,「TBtools」真的做了不少简化工作,大体如下:

  1. 做了 Rserver.plugin
  2. 做了 DESeq2 Wrapper 插件
  3. 为了确保能去运行,开发了 MetaPackageR 功能
  4. 为了让一切变得简单,做了 MetaR.plugin 模式,无需再用 MetaPackageR ,用户直接安装对应 R 插件就可以

整完这一系列...新的问题又出现了。大体情况就是:尽管有了示例数据和文件,用户准备起文件,还是会遇到各种各样的问题。
当然,我自己也经常忘了怎么去准备...
于是,干脆写一个简单功能,彻底解决这个事情。

Different Expression Analysis Prepare

这是一个非常简单的功能,打开方式如下



功能窗口只需要设置一个输入,建议使用直接给读段计数的 Raw Counts 矩阵,然后点击 Start



弹出窗口简单

分别对感兴趣的样品进行归组处理



如此重复,可以生成各类自己需要的两两比较组合

简单使用如下

效果就很好

写在最后

有些人想不到,
有些人看不上,
有些人不屑,
而时间,会给出答案。

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