Linux常见符号和常见报错

• 在使用Linux中，刚开始觉得符号很难理解和难记忆，用心体会，发现符号起很大的作用，提高效率。

• 做为初学者，学习Linux黑白命令行，很枯燥，加上遇到报错，不知道怎么去解决，有时候心里会凉半截，但有尝试独立解决报错，有成就感，整个人感觉复活过来。

• 多敲代码，错与解决错，不花money。

Linux常见符号及其含义

主要常见符号、通配符、正则表达式

常见符号及其含义_生信技能树Nickier老师课件图

把以上符号细讲：

#注释符号：这个最常被使用在脚本当中，视为说明，在后的数据均不执行

#与命令的演示

\：有转移符和续行符两种作用。(1)转义符：将【特殊字符或通配符】还原成 一般字符（在正则表达式里，有些符号不会被识别，需要加\去转义）；(2)续行符：在一句命令多行最后为续行符（这个续行的作用在以后讲到，一行命令写不完，不像R语言换行就可以，在Linux里，一句命令有很多行时，需要添加这个符号，\后面不能再有其它符号，包括空格也不行。）

|管道符(pipe)：分隔两个或是多个命令之间的符号（可能正则表达式里用到，但是大部分用于管道符）。

. .. 分别表示当前目录和上一层目录，. 在正则表达式指匹配任意的单个字符（除换行符之外）。

~用户的家目录（目前只用到这个作用，在awk里，~有其它作用，老师没讲是因为不常用）。

$两个作用：使用变量前导符（后期会讲）；正则表达式中的行末、最后。

!逻辑运算意义上的【非】not的意思。

/目录符号：路径分隔的符号（位置在中间或是最后，路径层级分隔符）；根目录（位置在最前面）；其它用法（在sed命令里，s ///的规则，awk命令里//去匹配关键词）。

> >>：分别表示重定向输出、追加（在cat命令里常用）。

<：重定向输入（有输入输出就有输入，输入平时很少用，不讲，感兴趣自行搜索）。

'' "" ： 单引号，变量不解释；双引号，变量解释。 sed 和 awk 的 script 常用单引号（在特殊情况下会用到双引号）。

`` ：反引号，中间的命令优先级高，先执行，作用 和 $() 一样（反引号在键盘上与波浪线是同一个按键）。

在Linux里有很多种类型的括号（一定是英文格式输入状态下，小括号()，中括号[]，花括号{}），自行搜索在什么情况下使用什么样的括号。

常见报错

主要的报错有三种：

• 找不到对象、找不到文件、文件不存在：No such file or directory

• 没有权限 ：Permission denied

• 命令不存在 ：command not found

（1）找不到文件、文件不存在：No such file or directory（与R语言里找不到对象是一个意思）

原因1：路劲不按tab键补全，如果tab键补全不出来，说明不存在该目录下，在该目录下不能操作，没法补全有可能是路径错，字母或是字符打错了，所以一定多用tab键，可以避免很多报错。

字母打错的报错

原因2：括号，引号不成对，符号，字母大小写的问题。

符号报错演示

（2） 没有权限 :Permission denied

不在自己的家目录下操作。不是管理员，没有权限操作根目录的文件

没有权限的操作报错

不是管理员，普通用户不能在根目录下或是别的用户下操作。

（3）命令不存在：command not found

比如pwd，打成pwk。

命令不存在的报错

之后会细讲什么时候存在能用，什么时候不能用

解决报错的方法：

（1）认真观察报错信息：Linux严格区分英文字母大小写，还有中英符号。

（2）常用ls 和pwd查看。

（3）搜索解决报错注意 :

• 如果答案提到用 root 用户(命令行提示符是 # )，或者提到的解决方法用到了 apt/yum/sudo ，表明部分操作是 管理员命令，需要注意自己是否有管理员权限
• 认清楚命令的结构: 命令 + 参数 + 文件（输出文件会给一个参数一个-o或是-O参数，然后指定一个文件或是一个文件夹）

（4） 输入文件 和 输出文件 的路径：

处理一个文件时候，给定一个路径就可以了，也不需要用cd，给出正确的路径。

ls -lh Data/example.gtf

（5）练成用tab键补全的习惯

初学者（非服务器管理者）要多敲代码和多观察，在Linux制造错误和解决报错除了时间成本外，不需要付出其它代价，所以多敲命令。

报错不可怕，解决报错的过程就是你进步的过程（来自小郭老师）

说明

以上内容是听生信技能树小郭老师授课内容以及参考课件图片（涉及的图片标明出处）。