2019-01-16

日记就拿来随便记一点日常工作。

今天想写的是这周要讲的文献。

menin deficiency.png

大概是讲Menin这个蛋白在星形胶质细胞里的减少会促进IL-1β——NF-κB通路的激活，而这和MEN1与p65的结合有关（这里的NMSA和co-IP以及NES用得很妙）。（星形胶质细胞的特异性是相对于排除Neuron和Microglia而言）

IL-1β是促炎的，所以抑制这一通路可以改善炎症缓解抑郁样行为，所以可以通过MEN1的抑制作用来治疗抑郁。

亮点三不是早八百年就在讲的东西了吗 但可以调查一下用的两种抑制剂和拮抗剂

有趣的地方主要还是在于EMSA和SNP上，少有看到文章在做SNP，尽管说本科的时候讲SNP还是讲比较多

introduction没什么特别的地方，results分为几块：

1、Menin Levels Are Attenuated in Mouse Brain after CUMS and LPS Exposure

2、Generation of Men1 Brain Cell-Type-Specific Conditional Knockout Mice

3、Mice with Astroglial Men1 Reduction Exhibit Depressive-like Behaviors

4、Astrocytic Menin Reduction Promotes IL-1b Production through NF-kB Activation

5、NF-kB Inhibitor and IL-1b Receptor Antagonist Ameliorate Depressive-like Behaviors in GcKO Mice

6、IL-1b-RA Rescues Neuronal Morphological Abnormalities and Synaptic Deficits Induced by Astroglial Menin Reduction

7、A MEN1 SNP Is Associated with MDD Risk

part 1 is nothing to argue about, just standard behaviour analysis

第二部分首先注意转基因鼠的构建（funny part is how they choose the genes to carry cre, for specification is always a goal to persue）

tips:Seven genes encode for the heavy (NF-H), medium (NF-M) and light neurofilament (NF-L) proteins, nestin and α-internexin in nerve cells, synemin α and desmuslin/synemin β (two alternative transcripts of the DMN gene) in muscle cells, and syncoilin (also in muscle cells).

Nestin (acronym for neuroectodermal stem cell marker) is a type V intermediate filament(IF) protein.These intermediate filament proteins are expressed mostly in nerve cells where they are implicated in the radial growth of the axon.

tip 2:Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase II (CaMkinase II or CaMKII) is a serine/threonine-specific protein kinase that is regulated by the Ca2+/calmodulincomplex.

关于FGFR3，还有疑问。（wiki上没讲到它对subventricular zone progenitor cells 和astrocyte的特异性何来）

图三是有趣的部分出现的地方

首先必须说明这里存在图注不清的状况……

RNA-seq和GO已经成为筛选方法……尽管结果并不意外（which indicates能够通过借用别人的信息来表示筛选）

EMS！

无法用放射性直接标记MEN1时，就用放射性标记的DNA来做反打

在蛋白/DNA结合中，可以与足迹法的优劣做一个评估

这里只是EMS证明了MEN1的存在影响了P65对DNA的结合，但并不是指MEN1与P65相结合，在接下来的IP中发现其实是menin与P65的蛋白结合影响了P65与DNA的结合

之后的接上NES来探究核内相互作用蛮妙的，虽然是分子standard，但做这个的也少

（277-541区段的发现方式不明，也没有写文献）

四和五没什么好说的，都是关于IL-1β和NF-κB的对抑郁样行为的功能验证

之后筛选SNP，并对SNP的作用进行验证，用的IP和EMS都是之前用到过的，至此在实验设计上没有什么特别的了。