生信log10|网页版｜RobeTTaFold-蛋白质预测尝鲜记

最近AlphaFold2开源了，然后另一个灵感来自AlphaFold的RobeTTaFold （点击蓝字直达官网首页）也开源了，相比AlphaFold2那T量级的docker安装，RobeTTAFold显然对我等小民真的太友好了，还有网页版，干脆尝尝鲜。

RobeTTAFold网站主页

robeTTaFold主页

• 点击Submit：可以提交自己的数据（第一次需要注册，后面登入即可）
• 点击Queque：查看服务器还有多少job
• 点击Example：：查看例子预测后的页面长啥样的

预测结果例子

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接下来是网页提交数据的流程

数据提交

数据提交页面

• Target Name：序列名字
• Protein sequence：蛋白质序列（序列就行了，不用带“>")
• 下面有Otional可以选择不同的模型预测，鼠标移到? 可查看解释说明

数据状态页面

• 数据页面能够看到自己的数据预测进展，点击上方+能再添加其他预测序列
  （上传上限没测过）
• 太多人了到现在都没有结果😭。

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二更，后续结果

• 如果完成了预测，状态(Status）会显示成active，点开后会提供Domain的ID

后台结果
Domain结果 大家都想尝鲜
结论：尝鲜失败，螃蟹不好吃，目前Alphafold2很RoseTTAFold都是针对人源，微生物源的还需后续数据的扩充才能使得上，笔主也在尝试里面的其他选项，奈何大家都想尝鲜，要排好久队呀（一周才能拿到结果）

知乎地址：https://zhuanlan.zhihu.com/p/391150855

PS：原创不易，各位客官走过路过点个赞👍呗