NCBI upload raw data

文章在发表前一般都要上传NCBI，高通量的原始数据通通都要上传，网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

基本上包括metadata,rawdata,preprocesssed data，同时原始data要备注md5值。

数据上传的基本步骤是：将raw data压缩，三个必须的文件存在一个以ncbi账户名命名的文件夹里；之后用户名登录，选择Submitting high-throughput sequence data to GEO，upload时，采用ftp 方式上传：

Here's a typical 'ncftp' session:

1.Run 'ncftp' shell command and then ensure passive mode is on:

ncftp

set passive on

2.Open connection to the geo server:

open ftp://geo:33%259uyj_fCh%3FM16H@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov

3.Transfer an entire directory (named using your GEO username) plus content using:

put -R GEOusername_directory