linux作业6-10题
2019-04-06 本文已影响4人
鱼啸九天
六.在第五题创建的每一个文件夹下面都 创建第二题文本文件 me.txt ,内容也要一样。
按jimmy的教程用touch命令创建每个me.txt,可惜不能成功,因此采用另外一种方面,首先在vim下创建me.txt并写入内容。

第二步采用管道命令
echo folder{1..5}/folder{1..5} | xargs -n 1 cp -v me.txt

七,再次删除掉前面几个步骤建立的文件夹及文件
采用批量删除命令
rm -rf folder*

八、下载 http://www.biotrainee.com/jmzeng/igv/test.bed 文件,后在里面选择含有 H3K4me3 的那一行是第几行,该文件总共有几行。
第一步,先下载

第二步,用grep命令
grep -no H3K4me3 test.bed

九、下载 http://www.biotrainee.com/jmzeng/rmDuplicate.zip 文件,并且解压,查看里面的文件夹结构
wget -c http://www.biotrainee.com/jmzeng/rmDuplicate.zip
unzip rmDuplicate.zip
tree rmDuplicate

十.打开第九题解压的文件,进入 rmDuplicate/samtools/single 文件夹里面,查看后缀为 .sam 的文件,搞清楚 生物信息学里面的SAM/BAM 定义是什么。
cd rmDuplicate/samtools/single
less -S tmp.sam
