生信星球培训第131期

Day3——边边

2022-03-30  本文已影响0人  莫婵无边

如何将miniconda下载到服务器上

怎么安装miniconda

  1. 输入bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh;
  2. 中间的过程,有enter按enter,有yes按yes;
  3. 出现Thank you for installing Miniconda3!,说明安装成功;
  4. 如果失败,删除miniconda目录,从bash重来;
  5. 激活,输入source ~/.bashrc,再输入conda。

添加镜像(这步不能省略)

conda在国外,我们在国内下载软件速度会很慢,因此需要配置镜像,输入以下代码。


Snipaste_2022-03-30_20-49-00.png

使用conda

  1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表,conda list;
  2. 安装软件conda install fastqc -y,如果出现以下情况,说明没有配置镜像;


    Snipaste_2022-03-30_20-48-17.png
  3. 确认fastqc软件是否安装成功,输入fastqc --help,如果出现一大片文字,这是软件的帮助文档;
  4. 卸载软件,conda remove fastqc -y,这边我就卡住不动了,按crtl+C取消就行。


    linux环境下的软件安装.png
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