R四种风格展示挑选的GO富集结果

GO富集分析相信大家都不陌生，在很多的SCI文章里面都会看到。相信大家应该都见过像下面这样的气泡图或者柱形图。

前面小编给大家系统的介绍了

☞ R进行GO和KEGG富集分析及结果可视化

☞ DAVID进行GO/KEGG富集分析及结果可视化

也给大家讲解过

☞ 展示DAVID富集分析结果中感兴趣的GO条目和KEGG通路还用视频给大家详细演示了

☞ 如何挑选感兴趣的KEGG通路进行展示

☞ 如何挑选感兴趣的GO条目进行展示

最后我们带着大家用R语言来展示了挑选出的感兴趣的KEGG通路

☞【R】气泡图和柱形图展示挑选的KEGG通路

今天我们来用R语言通过上面提到的四种风格来展示挑选出的GO条目。GO富集分析结果跟KEGG富集分析结果最大的区别在于，KEGG只有一种类型，所以富集出的结果可以不加区分的在一张图上进行展示。而GO因为又能进一步的划分成BP，MF和CC，因此我们在展示的时候需要加以区分。

区分的方法大体有三种，一种是通过物理区隔的方式，就像上面展示的图一和图二一样。我们使用三个分开的框来分别的展示BP，MF和CC。第二种方式是通过不同的颜色来区分BP，MF和CC，如图三所示。第三种方法是通过打标签的方式来实现，如图四所示，在GO条目名称的后面人为的加上【BP】，【MF】和【CC】。

具体实现的步骤

1）从完整的GO富集分析结果种挑选自己感兴趣的GO条目，一般是BP，MF和CC个挑选10条，当然挑选20条也是可以的。需要注意的是，挑选出来的GO条目矫正之后的p值（p.adj或者FDR）还是需要满足<0.05。具体挑选的方法可以参考下面的视频☞ 如何挑选感兴趣的GO条目进行展示

2）利用R的ggplot2包来展示结果。