Optimal Transport Problem

"OT问题"全称是"最优传输问题"（Optimal Transport Problem）。最优传输问题是一种在数学和计算科学中常见的问题，它涉及如何以最有效（通常是最经济）的方式将一种资源（如物品、人员或信息）从一组源位置传输到一组目标位置。这个问题最早是由法国数学家Gaspard Monge在18世纪提出的，因此也常被称为"Monge-Kantorovich问题"。

在细胞生物学的应用中，"最优传输问题"通常被用来衡量细胞状态的转换。例如，最优传输问题被用来匹配早期和晚期的细胞。在这种情况下，"源"可能是在时间点A的细胞状态，而"目标"可能是在时间点B的细胞状态。最优传输算法会找到一种最经济的方式，将A时间点的细胞状态转换为B时间点的细胞状态，这种"经济"可以被理解为细胞状态转换的可能性或者需要的"成本"。

这种方法在理解细胞命运决定（如细胞分化过程）等问题中有广泛的应用。例如，Waddington的表观遗传学景观是一个经典的模型，用来描述细胞从未分化状态向特定细胞类型分化过程中的状态转换，最优传输问题可以被用来定量地描述这种状态转换的过程。