收藏几个单细胞可视化包
2024-12-14 本文已影响0人
生信云笔记
好看的图当然会锦上添花，单细胞美化的包很多，也各有特色，不妨收藏几个，方便以后事半功倍地画出漂亮的图。
- 链 接：https://pwwang.github.io/scplotter
- 特 点：全面涵盖单细胞可视化，包含常规可视化、拟时序、细胞通讯、功能富集以及TCR相关展示等。
- 展 示：
- 链 接：https://github.com/TheHumphreysLab/plot1cell
- 特 点：涵盖常见的单细胞可视化美化，可以画高颜值的圈圈降维图。
- 展 示：
- 链 接：https://samuel-marsh.github.io/scCustomize
- 特 点：涵盖常见的单细胞及部分空间组可视化图，并且内置了不少可选的调色板，另外包装了
Nebulosa包的marker基因密度图。 - 展 示：
- 链 接：https://junjunlab.github.io/scRNAtoolVis-manual
- 特 点：涵盖常见的单细胞可视化，其中细胞类型的火山图及marker展示很不错。
- 展 示：
- 链 接：https://scillus.netlify.app/vignettes/plotting
- 特 点：涵盖常见的单细胞可视化。
- 展 示：
