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果子学生信一周汇总(6月10-6月16)

2019-06-17  本文已影响34人  9d760c7ce737

本周开启了预期6个月的写作模式,今天总结一下,说实话就是摸着石头过河。
一开始用了一个简单的帖子起头,因为既往的经验告诉我,如果调子起高了,后面高音部分上不去。
快速删除向量的最后一个元素,你有什么方法?

后面我写了一个帖子解决了GEO芯片差异分析的问题,limma做差异分析的两种方法,如果多组差异分析该如何分析,配对样本该如何分析。
GEO芯片分析中的大坑,差异基因完全相反!
GEO芯片如果超过了两组,也可以一次搞定差异分析
GEO芯片中配对样本如何做差异分析

写完这些帖子,我心里轻松了很多,因为我不需要再回答线下学员的这些问题了,直接把这些链接插入到课程作为参考资料。
在上面三个帖子中,有一个技能在里面发挥了很大的作用,就是因子的排序
所以,最终我又写了一个一个帖子作总结,并且在里面阐述了接下来的写作计划。
因子(factor)就像贤内助,让你始终分清主次,拨开云雾。


到了这里,我都比较轻松,因为这属于存量输出,这些技能都是我会的,所以,每一周我又会安排一两个不会的技能作为增量输出。简单说来,

存量输出是为了学员以及公众号的读者,增量输出是为了自己能有长足的进步。

本周的增量输出是去学习了贝塞尔曲线。
无处不在的贝塞尔曲线


这个帖子里面介绍的游戏强烈建议大家通关,因为这个技能在PS以及正在准备的PPT课程中会很有作用。
另外一个帖子写的是R语言生产动图的R包,gganimate
如何让你的基因放烟花

而最后一个帖子里面讲到的技能,属于论文中用不到,但PPT里面呈现效果超级棒的技能。这些都属于PPT课程的内容,说到底,

我们不是为了炫酷而炫酷,我们就是觉得合适。

而今天我们介绍一下,如果看到一个技能有用,如何找到更屌的例子,其中一个方法就是看Tweet。
只要在Tweet输入gganimate,就可以看到很多别人晒的图,简单说来,只要你的数据中有一个变量跨越了时间,空间,或者这个变量的内容特别多,都可以用动图来呈现。

=

我比较喜欢的是,有人用它来展示足球场上的信息。



当和ggforce这个包结合起来的时候,效果更佳炸裂



而这个ggforce包,我觉得他里面的功能都很不错,我们的贝塞尔曲线就是这个包画的。

总结和展望

总的来说,第一周过的比较顺利,当我头脑一热准备开启连续6个月写作模式的时候,我什么都没准备,但是我心里就一个标准,每天的要求不要太高,甚至我可以接受缺席的情况。
毕竟过往的经验告诉我

完成比完美重要,好的开始是成功的一半,但只要开始,即使不是好的开始,就已经是成功的1/3了。

接下来要要分享的主题是,甲基化分芯片分析,TCGA的基础技能,WGCNA,microRNA的分析,多芯片联合分析,免疫浸润,肿瘤微环境,这些内容大部分都是线下课程的补充,我要构建一个属于临床医生的完整的生信学习体系。
我觉得讲完了这些之后我就开始NGS的征程,直接开启大剂量冲击疗法。
我是果子,明天见啊。

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