生信星球学习小组第11期Day--3 王建新
2018-12-19 本文已影响5人
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今天是第3天,主要是Linux环境下的软件安装
Linux环境下的软件安装.png
如何下载miniconda
搜索“miniconda” 找到linux系统适合自己服务器位数的安装python3.6对应的版本下载链接
wget 下载链接
如何安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
注:最后还得激活:source ~/.bashrc 来激活conda
添加国内镜像
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
开始使用conda
查看当前所有软件列表 conda list
搜索软件 conda search fastqc
安装软件 conda install fastqc -y
卸载软件conda remove fastqc -y