生物信息学-小白成长记

R语言-0基础学习4-实战1-常见操作

2020-04-22  本文已影响0人  lietobrain

R语言学习系列
R语言-0基础学习1-数据结构
R语言-0基础学习2-构建子集
R语言-0基础学习3-循环排序信息处理函数
R语言-0基础学习4-实战1-常见操作

读取数据

操作路径

setwd('path')                       # 设置当前路径
getwd()                             # 查看当前目录
# 举例:
# mac
setwd('/Users/Tom/R')
# windows
setwd('C:/Users/Tom/Destop/R')

加载与操作工具包

library(survival)                   # 加载survival工具包
biocLite('package')                 # 安装package工具包
install.packages('package')         # 安装package工具包
remove.packages('package')          # 删除package工具包
update.packages()                   # 更新所有工具包
source('https://bioconductor.org/biocLite.R')   # 根据URL的方式来下载对应的工具包

packages(all.available=T)           # 查看所有package
search()                            # 查看已经加载的 package
detach(package:package1)            # 移除不需要的package1包

数据类型转换

data<-as.character(number);     # 将数字类型的数据,number转为字符串的data
data<-as.numeric(string);       # 将数字符串的数据,string转为数字类型的data
data<-as.array(original);       # 将original转为数组类型的data
data<-as.data.frame(array);     # 将矩阵类型的数据,original转为数据框类型的data
data<-as.matrix(original);      # 将original转为矩阵类型的data
is.character(data);             # 判断data是什么类型

加载数据

#创建一个example变量,读取example.txt到example上
example<-read.table('example.txt',fill=TRUE,head=TRUE)      
head(example)               # 显示example变量的前行数据
os<-example[,'survival']    # 将example变量的surival相关数据输出到os变量
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